Este Museu é propriedade da Santa Casa da Misericórdia de Aljezur e fica situado no centro histórico da vila de Aljezur, anexo à Igreja da Misericórdia

Este museu encontra-se instalado no antigo hospital da Misericórdia de Aljezur, edificado nos finais do século XVIII, tendo sido posteriormente transformado em Lar da Terceira Idade.
Com a transferência do lar para a parte nova de Aljezur (1985) e a ampliação do referido Lar (1997) ficou devoluto o antigo edifício. Assim, por decisão da Mesa Administrativa da Santa Casa da Misericórdia de Aljezur (1996) foi decidido instalar no antigo hospital um museu de temática religiosa (Arte Sacra), com o espólio da Misericórdia de Aljezur, da Paróquia de Nossa Senhora da Alva e com algumas ofertas e aquisições.
Inaugurado em 2000, o patrono é o ilustre aljezurense Monsenhor Cónego Manuel Francisco Pardal (1896/1979).